Αφού το σύστημα RO σταματήσει να τρέχει, γενικά πρέπει να ξεπλύνει αυτόματα για μια χρονική περίοδο και στη συνέχεια να αποφασίσει εάν θα λάβει μέτρα προστασίας τερματισμού ή τι είδους μέτρα προστασίας τερματισμού λήψης πρέπει να ληφθούν ανάλογα με το χρονικό διάστημα τερματισμού. Όταν το σύστημα επεξεργασίας νερού ενεργοποιηθεί και πάλι, για το σύστημα που έχει προστεθεί με απενεργοποιημένους προστατευτικούς παράγοντες, αυτοί οι προστατευτικοί παράγοντες πρέπει να εκφορτωθούν και στη συνέχεια οι προστατευτικοί παράγοντες πρέπει να ξεπλυθούν από μη-πίεση και τελικά το σύστημα πρέπει να είναι επανεκκινήθηκε.
Αφού ο εξοπλισμός RO σταματήσει να λειτουργεί, γενικά χρειάζεται να ξεπλύνει αυτόματα για μια χρονική περίοδο και στη συνέχεια να αποφασίσει εάν θα λάβει μέτρα προστασίας τερματισμού ή τι είδους μέτρα προστασίας από τερματισμό θα ληφθούν ανάλογα με τη διάρκεια του χρόνου τερματισμού λειτουργίας. Όταν το σύστημα αντίστροφης όσμωσης ενεργοποιείται ξανά, για το σύστημα που έχει προστεθεί με απενεργοποιημένους προστατευτικούς παράγοντες, αυτοί οι προστατευτικοί παράγοντες πρέπει να εκφορτωθούν και στη συνέχεια οι προστατευτικοί παράγοντες πρέπει να ξεπλυθούν από μη-πίεση και τελικά το σύστημα πρέπει να είναι επανεκκινήθηκε.